Kirill bắt đầu chơi bóng từ lúc 4 tuổi. Năm 1993, Kirill và em trai Dmitri gia nhập học viện bóng đá Spartak Moskva. Sau mâu thuẫn với huấn luyện, hai anh em rời Spartak và gia nhập học viện Dynamo Moskva.

Kirill có màn ra mắt đầu tiên cho đội một của Dynamo vào ngày 20 tháng 9 năm 2006 trong trận đấu tại Cúp bóng đá Nga trước Nizhny Novgorod.

Vào tháng 8 năm 2010, anh em nhà Kombarov rời Dynamo Moskva đến đầu quân cho kình địch Spartak Moskva nơi họ đã bắt đầu chơi bóng.[1]